Nature Genetics:新型標(biāo)志物可預(yù)測(cè)癌癥患者對(duì)化療是否耐藥


  市場(chǎng)動(dòng)態(tài)     |      2025-06-25
摘要:研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)出一種方法,可以預(yù)測(cè)哪些患者不會(huì)對(duì)常用的化療藥物產(chǎn)生應(yīng)答。
化療是摧毀腫瘤細(xì)胞的一種策略。幾十年來(lái),它一直是治療癌癥的標(biāo)準(zhǔn)方法。然而,化療并非總是有效。
西班牙國(guó)家癌癥研究中心(CNIO)計(jì)算腫瘤學(xué)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人Geoff Macintyre解釋說(shuō):“化療對(duì)某些患者有效,但并非適用于所有病例。20%到50%的癌癥患者對(duì)這些藥物沒(méi)有應(yīng)答。他們將承受化療帶來(lái)的副作用,卻無(wú)法獲得任何臨床收益?!?/div>
利用染色體不穩(wěn)定性特征預(yù)測(cè)化療耐藥性圖1 利用染色體不穩(wěn)定性特征預(yù)測(cè)化療耐藥性
Macintyre領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)與劍橋大學(xué)和初創(chuàng)公司Tailor Bio合作,開(kāi)發(fā)出一種方法,可以預(yù)測(cè)哪些患者不會(huì)對(duì)常用的化療藥物(如鉑類(lèi)、紫杉類(lèi)和蒽環(huán)類(lèi)化療藥物)產(chǎn)生應(yīng)答。
這項(xiàng)研究成果于6月23日發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上。
作者表示: “重要的是,我們的研究為多種藥物引入了患者分層的生物標(biāo)志物,這些藥物原本并不是作為靶向療法開(kāi)發(fā)的。”
共同第一作者、西班牙國(guó)家癌癥研究中心的Joe Sneath Thompson表示:“我們的基因組檢測(cè)可以定量三種化療藥物的生物標(biāo)志物。該檢測(cè)適用于多種不同類(lèi)型的癌癥,因此,我們的研究成果每年有望惠及數(shù)十萬(wàn)名患者?!?/div>
眾所周知,許多腫瘤細(xì)胞的染色體數(shù)量會(huì)逐漸發(fā)生變化,其后果之一是癌細(xì)胞缺乏正確數(shù)量的遺傳物質(zhì)。
這些染色體變化在每個(gè)腫瘤中各不相同,但它們共同形成了染色體不穩(wěn)定性(CIN)的特征或標(biāo)記。這項(xiàng)新研究基于這些CIN特征開(kāi)發(fā)出生物標(biāo)志物。
這些生物標(biāo)志物讓我們能夠“提前檢測(cè)出哪些患者對(duì)這些治療具有耐藥性,這樣他們就可以避免不必要的副作用”,Macintyre解釋道。
 優(yōu)化用于預(yù)測(cè)泛癌種化療耐藥性的生物標(biāo)志物
圖2 優(yōu)化用于預(yù)測(cè)泛癌種化療耐藥性的生物標(biāo)志物
研究人員利用靶向捕獲基因組合測(cè)序、低深度全基因組測(cè)序和計(jì)算分析,以CIN特征為基礎(chǔ)來(lái)預(yù)測(cè)化療耐藥性。他們的分析聚焦于840名接受鉑類(lèi)、紫杉類(lèi)或蒽環(huán)類(lèi)化療的癌癥患者。
這種方法擴(kuò)展了人們對(duì)化療藥物作用機(jī)制的認(rèn)識(shí)。例如,鉑類(lèi)化療會(huì)引入較大的DNA加合物,而核苷酸切除修復(fù)功能受損的腫瘤難以修復(fù)這些加合物。此外,同源重組功能受損的腫瘤難以修復(fù)化療引起的雙鏈DNA斷裂。
研究人員隨后利用乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌或肉瘤患者的回顧性數(shù)據(jù),在隨機(jī)對(duì)照臨床試驗(yàn)中進(jìn)行模擬。他們發(fā)現(xiàn),CIN標(biāo)志物能夠揭示與三種化療引入的DNA損傷存在合成致死相互作用的突變是否存在。
具體來(lái)說(shuō),他們利用CIN標(biāo)志物篩選出對(duì)紫杉類(lèi)和蒽環(huán)類(lèi)藥物存在耐藥風(fēng)險(xiǎn)的卵巢癌病例,以及對(duì)紫杉類(lèi)或蒽環(huán)類(lèi)化療耐藥風(fēng)險(xiǎn)增高的轉(zhuǎn)移性乳腺癌和前列腺癌病例。
研究人員表示:“這項(xiàng)研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了染色體不穩(wěn)定性特征在預(yù)測(cè)多種癌癥化療耐藥性方面的臨床價(jià)值,有望將‘一刀切’的化療方案轉(zhuǎn)變?yōu)榫珳?zhǔn)的個(gè)性化治療?!?/div>
據(jù)Macintyre介紹,Tailor Bio公司是從劍橋大學(xué)分拆出來(lái)的,旨在基于這些CIN特征構(gòu)建精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)平臺(tái)。
“Tailor Bio打算將該檢測(cè)商業(yè)化,同時(shí)利用該技術(shù)對(duì)患者進(jìn)行分層,以便嘗試新療法(例如通過(guò)與Volastra合作進(jìn)行KIF18A抑制劑臨床試驗(yàn)),” Macintyre說(shuō),并指出該公司也在針對(duì)染色體不穩(wěn)定的腫瘤開(kāi)發(fā)治療方法。
參考資料
[1] Predicting resistance to chemotherapy using chromosomal instability signatures

 

摘要:研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)出一種方法,可以預(yù)測(cè)哪些患者不會(huì)對(duì)常用的化療藥物產(chǎn)生應(yīng)答。
化療是摧毀腫瘤細(xì)胞的一種策略。幾十年來(lái),它一直是治療癌癥的標(biāo)準(zhǔn)方法。然而,化療并非總是有效。
西班牙國(guó)家癌癥研究中心(CNIO)計(jì)算腫瘤學(xué)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人Geoff Macintyre解釋說(shuō):“化療對(duì)某些患者有效,但并非適用于所有病例。20%到50%的癌癥患者對(duì)這些藥物沒(méi)有應(yīng)答。他們將承受化療帶來(lái)的副作用,卻無(wú)法獲得任何臨床收益?!?/div>
利用染色體不穩(wěn)定性特征預(yù)測(cè)化療耐藥性圖1 利用染色體不穩(wěn)定性特征預(yù)測(cè)化療耐藥性
Macintyre領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)與劍橋大學(xué)和初創(chuàng)公司Tailor Bio合作,開(kāi)發(fā)出一種方法,可以預(yù)測(cè)哪些患者不會(huì)對(duì)常用的化療藥物(如鉑類(lèi)、紫杉類(lèi)和蒽環(huán)類(lèi)化療藥物)產(chǎn)生應(yīng)答。
這項(xiàng)研究成果于6月23日發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上。
作者表示: “重要的是,我們的研究為多種藥物引入了患者分層的生物標(biāo)志物,這些藥物原本并不是作為靶向療法開(kāi)發(fā)的?!?/div>
共同第一作者、西班牙國(guó)家癌癥研究中心的Joe Sneath Thompson表示:“我們的基因組檢測(cè)可以定量三種化療藥物的生物標(biāo)志物。該檢測(cè)適用于多種不同類(lèi)型的癌癥,因此,我們的研究成果每年有望惠及數(shù)十萬(wàn)名患者?!?/div>
眾所周知,許多腫瘤細(xì)胞的染色體數(shù)量會(huì)逐漸發(fā)生變化,其后果之一是癌細(xì)胞缺乏正確數(shù)量的遺傳物質(zhì)。
這些染色體變化在每個(gè)腫瘤中各不相同,但它們共同形成了染色體不穩(wěn)定性(CIN)的特征或標(biāo)記。這項(xiàng)新研究基于這些CIN特征開(kāi)發(fā)出生物標(biāo)志物。
這些生物標(biāo)志物讓我們能夠“提前檢測(cè)出哪些患者對(duì)這些治療具有耐藥性,這樣他們就可以避免不必要的副作用”,Macintyre解釋道。
 優(yōu)化用于預(yù)測(cè)泛癌種化療耐藥性的生物標(biāo)志物
圖2 優(yōu)化用于預(yù)測(cè)泛癌種化療耐藥性的生物標(biāo)志物
研究人員利用靶向捕獲基因組合測(cè)序、低深度全基因組測(cè)序和計(jì)算分析,以CIN特征為基礎(chǔ)來(lái)預(yù)測(cè)化療耐藥性。他們的分析聚焦于840名接受鉑類(lèi)、紫杉類(lèi)或蒽環(huán)類(lèi)化療的癌癥患者。
這種方法擴(kuò)展了人們對(duì)化療藥物作用機(jī)制的認(rèn)識(shí)。例如,鉑類(lèi)化療會(huì)引入較大的DNA加合物,而核苷酸切除修復(fù)功能受損的腫瘤難以修復(fù)這些加合物。此外,同源重組功能受損的腫瘤難以修復(fù)化療引起的雙鏈DNA斷裂。
研究人員隨后利用乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌或肉瘤患者的回顧性數(shù)據(jù),在隨機(jī)對(duì)照臨床試驗(yàn)中進(jìn)行模擬。他們發(fā)現(xiàn),CIN標(biāo)志物能夠揭示與三種化療引入的DNA損傷存在合成致死相互作用的突變是否存在。
具體來(lái)說(shuō),他們利用CIN標(biāo)志物篩選出對(duì)紫杉類(lèi)和蒽環(huán)類(lèi)藥物存在耐藥風(fēng)險(xiǎn)的卵巢癌病例,以及對(duì)紫杉類(lèi)或蒽環(huán)類(lèi)化療耐藥風(fēng)險(xiǎn)增高的轉(zhuǎn)移性乳腺癌和前列腺癌病例。
研究人員表示:“這項(xiàng)研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了染色體不穩(wěn)定性特征在預(yù)測(cè)多種癌癥化療耐藥性方面的臨床價(jià)值,有望將‘一刀切’的化療方案轉(zhuǎn)變?yōu)榫珳?zhǔn)的個(gè)性化治療?!?/div>
據(jù)Macintyre介紹,Tailor Bio公司是從劍橋大學(xué)分拆出來(lái)的,旨在基于這些CIN特征構(gòu)建精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)平臺(tái)。
“Tailor Bio打算將該檢測(cè)商業(yè)化,同時(shí)利用該技術(shù)對(duì)患者進(jìn)行分層,以便嘗試新療法(例如通過(guò)與Volastra合作進(jìn)行KIF18A抑制劑臨床試驗(yàn)),” Macintyre說(shuō),并指出該公司也在針對(duì)染色體不穩(wěn)定的腫瘤開(kāi)發(fā)治療方法。
參考資料
[1] Predicting resistance to chemotherapy using chromosomal instability signatures

 

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